遊戲分為男女主雙線劇情，在進入遊戲後我們選在兩位主角中選擇結人皇即可開始男主路線劇情。
朦朧中出現了一名少女的臉龐，她於危機中救出了我們的男主結人皇，在送給結人皇一個純白的飾品並鼓勵他要堅強的活下去後，結人皇失去了意識。
畫面一轉來到怪伐軍訓練生小隊處，可以使用超腦力的訓練生們在經過長時間的訓練後，需要通過連接SAS來完成最後的考驗。而首次連接SAS時會帶來強烈無比的痛楚，整支訓練小隊只有結人皇與另一名男性隊員通過了考驗。
隨後我們需要通過一場適應性測試訓練，來決定在正式加入怪伐軍後加入哪支小隊。而適應性訓練實際上為遊戲基礎操作教程。
進入訓練後，在界面正中間的人物則為我們的主角結人皇，正中間下方的紅色電波圖代表玩家角色當前的生命值，在被怪異攻擊後會損失生命值，當生命值為零角色會死亡並從最近的存檔點重新開始挑戰。界面右上角為小地圖，我們可以通過小地圖查看附近的道路和任務目標大致的方位。
我們可以通過WASD移動角色，轉動滑鼠或使用IJKL轉動畫面視角，按下R鍵可以重置鏡頭。
來到前方道路的斷裂處，按下空格鍵跳過此處繼續前進。
在道路前方我們首次遭遇怪異，結人皇的超腦力為使用念力，我們可以通過長按滑鼠右鍵是用念力控制周圍的物體攻擊怪異。
在周圍的物體上出現滑鼠右鍵的圖標時，則說明我們可以操縱該物體進行攻擊。在生命值上方的紫色能量條代表念力量表，使用念力能力會消耗念力值，當念力值降低至一定程度後則無法使用念力。念力值可以通過時間或攻擊怪異進行恢復。
當同時出現多名敵人時，我們可以通過按下Q鍵鎖定敵人，被鎖定的敵人身上會出現紅色的標記，念力攻擊會首先攻擊我們鎖定的敵人。按住Q鍵的同時按下J或L鍵可以切換鎖定目標。
除了念力攻擊外，結人皇還可以通過裝備的刀進行近戰快速攻擊。在近身攻擊時我們可以通過使用Shift鍵來進行閃身操作，在完美閃身後會有短暫無敵，在後期學習特定技能後還可以在閃身之後追加特定操作。
在面對空中的敵人時，我們可以在按住空格鍵的同時點擊滑鼠左鍵，可以打出向上揮砍攻擊。
按下C鍵可以發動較大范圍的特殊攻擊，特殊攻擊在每次連擊中只能夠使用一次，在命中敵人後能夠恢復較多的念力值。
除了基本的攻擊外，我們還能夠使用突擊追擊和念力追擊兩種特殊連擊。將兩種特殊連擊反復組合使用可以給予敵人巨額的傷害。
突擊追擊：在是用念力攻擊敵人後，快速按下滑鼠左鍵進行近戰攻擊，即可快速突進至鎖定的敵人身旁。
念力追擊：在普通攻擊或特殊攻擊的過程中，按下滑鼠右鍵使用念力攻擊。念力追擊的最大好處是我們可一邊恢復念力值一邊進行攻擊，避免了念力值不足的問題以延長連擊。
在訓練階段的最後我們需要擊敗一隻魁臂裂嘴，除使用嘴進行撕咬等近戰攻擊外，該敵人還會從嘴中向前發射沖擊波進行攻擊，躲避該怪異正面即可。
怪物手臂處的燈泡是其弱點，著重對此部位進行攻擊將該怪異消滅即可完成該訓練。
在成功完成訓練後結人皇就已經成為了怪伐軍的一員，而在正式加入怪伐軍小隊前每人擁有一天的自由活動時間。在剛剛離開怪伐軍大樓時，在廣場上見到了等待結人皇的訓練生隊友那岐卡門，在約定前往在皇陵舉辦的祭典後那岐卡門先行離開。
隨後離開怪伐軍駐地，沿著大街前往皇陵，在右上角的小地圖處目標地點會通過紅色嘆號標記出來。
在皇陵入口處可以見到負責保存遊戲進度的記錄人以及購買道具的商店。
在皇陵祭典與那岐卡門會合，通過二人的交談可以得知結人皇正是這個國家前代英雄的子孫。
離開皇陵重新回到街道時，城市中突然發生了怪異入侵事件，原本還是訓練兵的結人皇不應該與怪異戰鬥，但為了保護一對母女結人皇挺身而出與怪異戰鬥。
第一波怪物為兩只花瓷爪牙，該怪異會使用頭部巨大的花籃進行撞擊或發射花瓣，還能夠使用尾巴進行旋轉攻擊。
消滅兩只花瓷爪牙後迎來第二波怪物，第二波怪物由兩只花瓷爪牙和兩只卑賤貯池組成，將其消滅即可。
在結人皇消滅敵人後突然出現了一名白發的少女，而這名少女與結人皇印象中，曾經救過自己的人長得一模一樣。
正在此時突然出現一隻名為凋萎安息日的強大怪異，該怪異形似一頭巨大的公羊。
凋萎安息日的基本攻擊方法為使用身體側向進行撞擊，或使用蹄子踢向四周進行攻擊，攻擊方式相對單一直接將其消滅即可。
將怪異全部消滅後二人與重的姐姐直見還有那岐會合。隨後被怪伐軍的幹部從無人機的瘋狂采訪下帶出，在被命令盡可能與媒體少接觸後眾人動身返回怪伐軍駐地。
通過街道返回怪伐軍駐地後接下來面對眾人的便是小隊分配，至此遊戲序章結束。
結人與那岐二人被分配至了塞特小隊，隨後塞特隊長決定舉行帶有訓練性質的實地防衛怪異入侵的任務。該任務會以兩兩組隊的形式進行，結人皇被分配到的隊友則是能夠使用火焰超腦力的青梅竹馬花火一條。
按Tab鍵打開世界地圖，隨後選擇前往黃朽葉的中層商店街開始任務。
沿著道路前進，穿過電子封條後與眾人會合。
隨後我們需要根據提示前往指定地點，當我們有隊友協助時界面右下角處會顯示出隊友的生命值和技能，通過按下1-4數字鍵可以使用隊友技能對結人皇進行各種強化。技能欄周圍一圈為SAS技能量表，使用隊友技能時需要消耗能量，能量會隨時間緩慢恢復。按下數字5鍵可以主動終止當前正在使用的能力。
花火一條的超腦力為火焰，因此在使用SAS技能後結人皇的武器會附著上火焰，攻擊會對敵人造成額外的火焰傷害，在對付油屬性敵人時格外有效。
首先我們需要面對的就是兩名油屬性敵人燃油貯池，利用花火的能力則可以快速將其消滅。
繼續前進，接下來我們要面對2隻花瓷爪牙和1隻燃油貯池。
通過區域右側的台階到達上層平台。
來到上層平台後在道路的右前方可以看到4隻卑賤吊怪，此處可以選擇不與怪物作戰直接通過台階繼續向上。
在前方可以看到一名記錄者，我們可以在此保存當前遊戲進度同時恢復自身狀態，隨後向右前方前進進入停車場。
在停車場中我們首先需要面對3隻花瓷爪牙，當周圍的環境中出現G標記的道具後，我們按下G鍵可以使用該道具對敵人發起特殊攻擊。
在特殊道具擊中敵人後我們需要根據提示輸入指令來完成追加攻擊，此處我們需要同時按下D和A鍵，在完成追加攻擊後能夠對敵人造成巨額傷害。
將花瓷爪牙消滅後會再次出現1隻凋萎安息日，該怪物的弱點為其後背上生長的類似花朵一樣的組織，攻擊該部位能夠快速將此怪異消滅。
通過停車場右前方處的台階繼續向上。
沿著道路前進消滅4隻卑賤吊怪。
來到道路盡頭後按下E鍵進入上層施工區中。
迎面而來的就是2隻花瓷爪牙和2隻卑賤吊怪。
利用地圖中的油桶進行特殊攻擊，隨後長按W鍵即可發動追加攻擊將油全部灑出，隨後配合花火的火焰能力即可輕松將其消滅。
通過台階向上，消滅路邊的兩只燃油貯池。
繼續前進在道路的拐角處再次出現2隻燃油貯池。
通過坡道繼續向上。
在消滅1隻燃油貯池後，與花火一條一同乘坐電梯來到建築工地的最上層。
在記錄人處補充一下狀態後沿著前方的坡道向上來到最高層，准備開始BOSS戰。
由於其他小隊還需要一段時間才能抵達，因此結人皇只得和花火一條一起二人迎戰強大怪異泥濁梨酒。該怪異身背一個巨大的壇子，會從壇子中發射一團燃油進行攻擊。
當泥濁梨酒生命值較低時，該招式會變為同時發射三團燃油。注意躲避該攻擊，如果被油擊中將陷入浸油狀態無法使用墊步，後續想要躲避怪異的攻擊將變得更為困難。
當我們在近距離對其發動攻擊時，泥濁梨酒會揮舞手臂進行反擊。
泥濁梨酒會在原地旋轉，對四周的敵人造成傷害。
當我們距離泥濁梨酒太遠時，它會直接從空中撲向我們所在位置，保持移動即可閃避此攻擊。
泥濁梨酒在飛撲落地後會用手腳不停的拍打地面，此時接近它會受到不低的傷害。但在泥濁梨酒匍匐地面時，我們可以按G拉扯上方的水泥管發動特殊攻擊。
在被水泥管擊中後泥濁梨酒會進入倒地狀態，完全失去行動能力任由我們隨意攻擊。而且由於該怪物渾身被油覆蓋，在其倒地時使用花火一條的能力進行火焰攻擊，能夠快速對泥濁梨酒造成大量傷害。
將泥濁梨酒擊敗後眾人與沿途相遇的重所在的小隊一同返回怪伐軍駐地，正當眾人准備休整時突然接到了其他小隊發送的求救信號，由於其他隊員都有要務或者傷病在身，只得由結人皇獨自前往。
按下Tab打開世界地圖，隨後選擇前往水波川新都市開發區中的施工區域。
來到施工區域後我們首先會遭遇1隻攜伙醉鬼，在該怪異的血條下方為其碎擊量表。我們通過攻擊能夠削減怪物的碎擊量，使用特殊連擊能夠更加快速的削減碎擊量。
當怪異的碎擊量降為零後，按下G鍵可以發動特殊攻擊直接將怪異秒殺。
沿著道路繼續前進，來到施工區域後我們要面對大量的敵人，在此區域中我們要消滅2隻卑賤醉鬼、5隻攜伙醉鬼以及1隻凋萎安息日。類似凋萎安息日的帶有甲殼防護的怪異，我們通過攻擊弱點破壞甲殼即可快速削減碎擊值。
在記錄人處補充好狀態後，通過後側的道路進入建築地下。
在建築地下我們與發出求救信號的嵐詩賓和蓋曼加里森會合，一同對抗出現在此處的怪異。我們在此會遭遇一種名為驅帶吊怪的怪異，該怪異擁有極快的移動速度，在正常情況下我們無法攻擊到該怪物，此時需要使用嵐詩賓的超腦力加快我們的速度從而消滅該怪異。
將兩名驅帶吊怪消滅後，繼續與此處的名為螺鑽安息日的怪異戰鬥。該怪異形似一隻巨大的馬匹，頭部有一個鋼鐵的鑽頭形狀的頭盔，其主要攻擊手段就是利用四肢和鑽頭進行攻擊。
螺鑽安息日會向四周地面釋放一層黑色的液體，停留在液體上會不斷受到傷害，此時我們可以使用曼加里森的超腦力為我們提供防護讓敵人的傷害失效。
連續攻擊鑽頭可以將其破壞使怪異的頭部暴露出來，攻擊其頭部能夠造成更多的傷害。
將螺鑽安息日消滅後眾人准備返回基地，但結人卻察覺到蓋曼的腿已經收了不輕的傷，於是決定帶二人前往附近的避難所。
在主線劇情的間歇我們會進入待命階段，待命階段中我們會來到結人的秘密基地，在此處充分休息後會完全回復狀態。在某些限制移動的劇情外，我們可以隨時回到基地進行休整。
在待命階段1中我們可以來到基地的餐廳，與坐在此處的花火一條交談，隨後開啟花火一條的羈絆任務。
與多年未見的青梅竹馬花火來到街上散步談心，結束後二人再次返回基地。
在完成羈絆任務後我們與花火一條的羈絆等級會上升，2級羈絆的花火不僅能為我們提供空中的大范圍攻擊，還能夠在我們受到攻擊時有一定機率免疫傷害。
來到基地客廳通過桌子的調查功能開啟下一步任務。
結人突然收到來自重發送的訊息，在信息中重邀請結人前往黃朽葉，在選擇回復該信息後即可開始與重的羈絆章節。
和重在黃朽葉見面後得知原來重是前來尋找賽特之前任務丟失的鋼筆，而作為賽特小隊一員的結人應該清楚鋼筆的樣子，同時也有一些問題想詢問結人，因此就將結人叫至此處。
沿著之前訓練任務時同樣的道路前進，並消滅途中遭遇的怪物。
重的超腦力能力與結人相同都為使用念力，因此通過重的SAS能夠進一步強化結人的能力，在SAS發動期間結人使用念力攻擊敵人不會消耗念力值，長按Y鍵可以發動念力空間技能，將附近所有能夠操控的物體同時砸向敵人造成巨額傷害。
來到建築頂層時突然出現大量敵人襲擊，與重配合將其全部消滅後本關卡結束。回到基地的起居室後，再次通過桌子的調查功能即可開始下一個階段的劇情。
在離開基地後結人不知怎麼的就來到了皇陵處。
正在此接到了來自那岐的信息，眾人正在給怪伐軍總部准備模擬戰，隨後我們來到街道返回怪伐軍總部。
眾人通過抽簽將小隊分配完畢後，結人與陽炎丹、紫電里特二人一組。陽炎的能力為透明化，在使用該能力後怪異將無法偵測到我們的存在，我們可以遊刃有餘的在怪異背後長按C鍵准備蓄力攻擊。
蓄力的特殊攻擊能夠大幅削減敵人的碎擊量，某些普通怪物甚至能夠直接將碎擊量清空，隨後按下G鍵即可將敵人秒殺。
沿著台階和坡道向上。
在前方我們會遭遇到水屬性的膽液貯池，紫電里特的能力為放電，通過SAS系統能夠使用電力強化結人皇的攻擊，改變攻擊方式的同時對浸水的敵人能夠造成高更的傷害。連續使用電屬性攻擊敵人，會使敵人進入麻痹狀態從而無法行動。
來到上層區域後可以看到此次模擬訓練的目標旗幟就在隔壁房間，但通往隔壁房間的大門被柵欄擋住，我們需要從另一側的通道到達上層房間，之後再進入旗幟所在房間。此時突然出現了數名怪異對我們發起攻擊，將其全部消滅即可。
在上層我們再次遭遇到敵人的圍攻，與夥伴配合將其消滅即可。
消滅怪物之後從房間正中央的通道離開。
在前方的房間中獲得訓練目標旗幟並消滅全部怪異。
之後再次回到上層房間，消滅全部怪異後跟隨牆壁上的緊急出口指示離開。
回到街道後繼續一邊清除怪異一邊向目的地前進。
來到之前的停車場時重突然出現准備搶奪結人的旗幟，隨後與重開始戰鬥。重使用念力飛刀進行攻擊，且由於超能力同樣為念力重也能夠操控物體進行攻擊。在重操控物體時，把握時機按下滑鼠右鍵即可進行攔截。
重的攻擊傷害非常高，我們需要保持不停的移動來躲避其攻擊，同時注意及時攔截重投擲的道具。此處不論是否將重擊敗都會進入下一步劇情。
在訓練結束後眾人各自解散，結人再次來到皇陵想找到之前莫名來到此處的原因。剛剛來到皇陵結人便接到了消息在廢棄地下軌道中出現了大量的怪異，需要立即趕往事發地清除怪異。
隨後我們打開世界地圖，選擇前往廢棄地下軌道蘇芳九號線的比良坂車站出入口。在與眾人會合後結人得知當前發生了十分罕見的特殊狀況。一直高懸在天空平流層處的斷絕之帶被認為是全部怪異的來源，而現在斷絕之帶卻降低了高度來到地面附近。
在廢棄地下軌道中結人將與陽炎和鶇組隊，鶇的超腦力能夠使我們觀測到隱身的敵人或敵人身上的弱點位置。從此處開始我們能夠使用一種名為腦驅動的全新能力，在攻擊敵人或受到傷害後會累計能量值，當生命值旁的腦驅動能量槽累計滿後會自動發動該技能。當腦驅動能力發動時，結人皇的攻擊、移動和是用念力的速度會提高。
在前方我們會首次遭遇名為足鋸爪牙的怪異，該怪異會使用隱身的能力，此時通過鶇的能力即可觀測到該怪異。
使用念力控制列車即可一次性消滅前方軌道上的全部怪異，隨後沿著軌道繼續前進。
消滅沿途的敵人來到廢棄線路內部後，使用陽炎的能力隱身到達怪物後方，操控列車即可將怪物全部消滅。消滅沿途的怪異深入廢棄軌道深處繼續調查，就在半途中突然收到重所在的鏡花小隊發來的求援信號，於是接下來要趕往鏡花小隊所在地點給予幫助。
來到鏡花小隊所在地點後，眾人遭遇了大量怪異的突襲，而賽特、陽炎和花火等人卻因為從天花板上掉落的巨石而和大部隊分開，緊要關頭之下也來不及尋找他們，必須先將出現的全部怪異清除。
在將出現的全部怪異消滅後，直見卻因為未知的原因變身成為了一個巨大的怪異。
直見蘭德爾頭部神龕下方的花叢是其弱點，進攻此處可以使其倒地。
直見蘭德爾神龕上的兩個人形頭像會發出吶喊，對其周圍的全部敵人造成傷害並將其擊退。
直見蘭德爾在生命值損失三分之一後會進入第二形態，在此形態下直見蘭德爾的行動和攻擊方式都會有所變化，它會使用背後的飄帶將其插入地面，隨後從地面刺出追蹤攻擊結人。
當直見蘭德爾將右手抬起並以詭異角度不停扭動時，我們要快速遠離其前方區域，隨後直見蘭德爾會用力砸擊地面對范圍內的敵人造成巨額傷害。
直見蘭德爾會轉動手臂揚起塵土以隱匿其身形，我們需要通過鶇的能力來穿透迷霧觀察到直見蘭德爾。
直見蘭德爾會向前撲出，使用頭部砸擊前方稍遠處的敵人。
直見蘭德爾會在短暫蓄力後，揮動手臂環繞攻擊周圍的敵人。
在即將消滅直見蘭德爾時，重突然出現攔在了眾人面前，但隨後直見和重卻突然被傳送去了未知地點。
眾人在廢墟中找到了直見遺留下來的道具，是上面印有青藍市市徽的安瓿。隨後作為小隊中狀態最好的二人，結人和蓋曼一起離開地下軌道繼續追蹤直見蘭德爾和重。
通過被碎石阻擋的軌道出口離開。
但正當二人准備離開軌道時，吹雪詩賓突然出現向結人要走了他剛剛撿到的安瓿，並告訴結人這是用於短期內強化超腦力的藥劑，同時要求二人對剛剛發生的事情全部保密。
在前方道路處結人找到了與卡連連隊長同行的重，得知直見是被青藍駐守軍強行帶走的。由於眾人都被告知不可張揚此事，所以決定自行進行調查。結人將之前偷偷留下的安瓿展示給重，卻得知在重小時侯層在家中見到過一模一樣的東西。重也告知結人卡連中隊長曾對她說過，現在統治國家的新日向政府並不能夠信任。
在將兩個安瓿放入吐吐神中並將其中一個交給重保管後，鶇和陽炎出現並告訴眾人其他夥伴均無大礙，隨後大家一同返回基地進行休整。
在返回基地休整時，選擇回復嵐詩賓的消息即可開始與嵐詩賓的羈絆增強任務。
嵐詩賓約結人在一家名為結緣家的飯店見面，原來嵐詩賓想要讓結人挑戰大胃王活動從而獲得免費贈送的可樂。
在成功完成挑戰後結人拜託嵐幫其調整SAS系統，使其能夠更好的配合戰鬥。在調整完畢後，二人返回基地繼續等待下一步的行動。
在休息室中與鶇對話即可開始鶇的羈絆章節。
由於鶇非常的喜歡植物，因此結人拜託她幫忙找一種結人小時侯家中種植的白色花朵，在鶇答應幫忙尋找後即可完成該章節。
我們在商店中可以用消滅怪異獲得的材料交換禮物，將禮物贈送給對應的角色後可以提高該角色的好感度，同時贈送的禮物還會出現在基地中。
在准備完畢後通過休息室的桌子開始下一步行動。
眾人在怪伐軍總部中集結准備開始行動，而之前受傷的那岐也已經痊癒出院。但那岐卻好像完全忘記了直見變為怪異的事情，而是堅定的相信直見已經陣亡，並且對於新日向表現出了狂熱的信仰。
隨後打開世界地圖選擇前往岐高速運輸公路的蘇芳一帶入口。
沿著道路前進，在前方我們會首次遭遇使用火屬性攻擊的怪異廚灶醉鬼，將其消滅後繼續前進。
在道路前方我們可以看到下圖所標記處的怪異，該怪異名為鼠輩輪跡，本體被堅硬的外殼所包裹，我們必須先使用念力攻擊破壞其外殼才能夠攻擊本體將其消滅。
在記錄人處保存並恢復狀態後，通過跳躍到達上方公路繼續前進。
在前方我們會遭到怪物的攔截，使用特殊能力控制油罐車可以製造劇烈爆炸對怪異造成巨額傷害。
當眾人來到休息區時，發現自己已經被其他怪伐軍包圍。而與卡連中隊長一同前來的蓋曼則宣稱賽特參與了某項邪惡的實驗試圖將賽特逮捕。
眾人危難關頭鏡花小隊出現，幫助賽特小隊引開怪伐軍使其能夠成功脫險。
就在此時卡連中隊長突然出現阻攔眾人離開。
隨後結人與夥伴們要與卡連戰鬥，卡連會使用瞬移從遠處突然發動襲擊，或飛至空中向下發射閃電，同時卡連的近身拳腳攻擊傷害奇高。此處我們無需將卡連擊敗，只需要堅持不死即可。
注意當卡連使用追蹤電球時，我們可以通過使用陽炎的技能使其失去目標從而憑空消散。
在堅持一段時間後卡連會將我們拉入一個奇特的空間之中，堅持30秒後無論是否擊敗卡連，都會強制進入劇情。
卡連召喚出了一陣強烈的火焰颶風將眾人吹散。
擊敗攔路的怪伐軍不斷前進，尋找失散的夥伴的下落。
當我們找到昏迷的那岐時，突然出現一隻巨大的怪異。正在此時賽特和重也來到此處，賽特負責照看那岐，由結人和重與怪異戰鬥。
酒釀脊怪會甩動它的尾巴攻擊敵人。
酒釀脊怪轉動頭部的閥門在身體前方製造處一片水幕，被淋中後會進入浸水狀態，無法使用墊步。
酒釀脊怪會揮舞拳頭進行攻擊。
酒釀脊怪可以向前方發射一個電球。
酒釀脊怪會在短暫蓄力後向前方沖出，但隨後會匍匐在地無法行動，我們可以趁此時發起快速攻擊。
酒釀脊怪身體後半段類似馬匹的部分是其弱點，攻擊此處能夠對其造成更高額的傷害。
將怪異擊敗後重對結人說卡連其實並不是敵人，卡連的目標也不是怪伐軍的隊友。但突然那岐向重和結人發起攻擊，而賽特卻挺身而出為二人擋下了那岐的攻擊，而賽特在對那岐的大腦使用了放電能力，應該是在試圖解除那岐的洗腦，隨後永遠的閉上了眼睛，隨身攜帶的鋼筆也掉落在了地面上。
而此時重卻又突發異常，在與結人的念力共鳴下，緩緩張開一個類似黑洞的存在。
隨後結人和重來到一個神秘空間中，看到一名疑似八雲皇的人被一名黑影殺死。隨後脫離了該神秘空間。
結人醒來後重與那岐已經不見蹤影，但卻與隨後趕到的花火、鶇和蓋曼會合，在攜帶上賽特的遺體後眾人先行前往基地休整。
回到基地後蓋曼告訴大家這一切都是卡連連隊長策劃的，目的是為了終止新日向對國民的監控和對反對這的精神操控。而之所以會襲擊賽特是由於卡連認為賽特有參與精神操控計劃，並且向蓋曼出示了強有力的證據。
而賽特的死和後續發生的一起讓蓋曼覺得事情可能並沒有那麼簡單，在真誠的向賽特和眾人道歉後，大家決定一同行動尋找真相。
回到休息室後與坐在沙發上的花火交談開啟羈絆章節。
在接連發生一系列事件後，花火對於自己加入怪伐軍是否正確產生了動搖，結人在認真傾聽並安慰了花火後二人重新返回基地。
完成該羈絆章節後結人與花火的羈絆等級到達3級，此時我們在與花火組隊時，花火超腦力的量表恢復速度會加快，同時在使用花火的超腦力時按下Ctrl+F1-4可以發動大范圍的特殊攻擊。
此待命階段僅有花火一個羈絆章節，完成之後即可通過休息室桌子的調查功能開始下一個故事章節。
為了調查動亂的真相結人和夥伴們一致決定，即便有可能會遭遇卡連和其他怪伐軍的阻攔也一定要前往蘇芳。在來到蘇芳後一直杳無音訊的渡終於出現，主動向結人發出心電感應並告知結人目前蘇芳的全部防衛系統已經停止運行，大量怪異湧入城市，為了保護普通民眾的安全結人小隊准備清除城市中的怪異。
在街道上結人遇見了吹雪連隊長，而吹雪則告訴結人卡連煽動怪伐軍並勾結青藍駐守軍襲擊了蘇芳，由於結人小隊並沒有受到卡連的招募，因此吹雪將結人小隊暫時歸入其麾下。在任命結人為小隊的臨時隊長後，請求他們消滅怪異引導怪伐軍總部中的官員前往避難所，同時結人的父親也在怪伐軍總部中。
在來到怪伐軍駐地時結人卻看到他的父親躺在地上，而重正蹲在他的父親並且手中握著一把沾血的匕首。
在結人還尚未來得及向重詢問事情經過時，重卻突然表示要完成與結人的約定將其殺死，隨後與重開始戰鬥。此時我們無需進攻重，只需和重迂迴拖延時間即可。
在久久僵持不下中結人強行發動能力將二人拉入腦內空間，在腦內空間中我們可以任意使用周圍的環境來進行進攻。
離開腦內空間後結人本想繼續與重戰鬥，但此時卡連突然發布了一個公告批判了新日向政府的種種暴行，並呼籲人們來到青藍和他一同推翻新日向的統治，在公告結束後重所在的鏡花小隊也趕忙離開此處。
而結人的父親也在留下一些語焉不詳的話語後由於傷勢過重與世長辭。
眾人隨後回到基地開始總結當前已知情報，目前有超過半數的怪伐軍前往青藍追隨卡連，同時有傳言宣佈青藍可能即將獨立。而之前算是卡連一派的蓋滿也由於之前賽特的事情，對卡連的行為產生了懷疑。而由於結人過度使用腦力已經非常疲憊，眾人決定短暫休息一段時間。
由於剛剛危急關頭使用了腦內空間能力，在之後的戰鬥中結人也可以再次使用該能力了。在腦驅動過程中按下B鍵即可使用該能力，不過在腦內空間中需要及時關注下方生命值旁的倒計時，需要在倒計時結束前按下B鍵關閉腦內空間，否則結人就會由於過度使用能力而導致大腦崩潰。
在基地中我們會首先受到來自鏡花伊登的信息，雖然暫時大家立場有所不同，但在選擇回復後依然可以開始提高鏡花羈絆的章節。
在聊天中鏡花表現出了對結人格外的關心，但卻以對所有夥伴都是如此掩飾了過去。在委婉拒絕了鏡花贈送的護身符後，結人與鏡花分別返回了基地。
回復紫電里特的郵件即可開啟與紫電的羈絆提升章節。
與紫電見面後得知原來賽特曾為紫電准備了一個禮物，但卻還未來得及交給紫電就已經犧牲了，因此紫電拜託結人幫其尋找。
在結人仔細尋找基地後發現了賽特留給紫電的箱子，打開箱子後發現是一件可以用來幫助釋放電能力的道具。在收下紫電態度惡劣的感激後，結人獨自返回基地。
與鶇交談開始鶇的羈絆提升章節任務。
一番交談後鶇告訴結人，她之所以會像現在這樣性格孤僻不擅長與人打交道，是由於小時候經常控制不住能力看到一些不該看的事情，從而被大家疏遠。所以在與爺爺一起生活的時候，在爺爺的引導下逐漸喜歡上了植物。
在認真傾聽完鶇的故事並鼓勵她後，我們與鶇的羈絆到達2級，在通過SAS使用鶇的能力時，以看穿攻擊打擊怪異時能夠一次性的破壞外殼，同時在使用鶇的能力時受到攻擊有一定幾率出現鶇的影像，幫助我們格擋此次攻擊使其無效。
與蓋曼交談開啟羈絆提升任務，蓋曼表示准備前往皇陵為自己的好友掃墓。
在掃墓結束後結人與蓋曼交談，蓋曼表示自己的年齡已經足夠，已經在考慮退休後的各項事宜。為了讓蓋曼重新找回年輕的人柑橘，二人約定下次一同去一個年輕人常去的。隨後二人返回基地，羈絆章節完成。
眾人在休息室中觀看新聞，得知重已成為疑似殺害結人父親的兇手而遭到了新日向政府的全面通緝。結人的哥哥皇總部長有事傳喚結人，於是接下來眾人准備前往蘇芳的總部。
但正在眾人前往總部的途中，結人突然出現了失憶的情況，對於是如何從基地來到此處，和剛剛被吹雪連隊長正式任命為怪伐軍01小隊隊長等事情的一概不知。
為了搞清楚結人失憶的原因眾人來到了怪伐軍醫院，在醫生檢查過後告訴結人並無太大問題，會給出結人開抑制荷爾蒙刺激腦部的藥物。
在醫院中結人看到了自己與吹雪連隊長見面並接受任命的新聞，回想起了自己確實被推崇為了這個國家救國的英雄。在新聞即將播報結人生涯史時，花火突然出現打斷了結人觀看新聞。
隨後花火提出要繼續帶結人在醫院中逛一逛，離開檢查室後右轉前往醫院大廳。
在醫院大廳中結人等人遭遇了一名無腦力者，而所有的無腦力者都會被冠以甜椒的代號。另外聽聞醫院正在進行相關研究，准備消除全部的無腦力者。對於甜椒這個代號，結人感覺異常熟悉但又想不起來什麼。
正在此時花火返回大廳，告訴眾人剛剛聽到情報地下有一輛專門運送病患的巴士，而鶇也證實了情報的正確性。但通常情況下運送病患的巴士會停在正門，而地下通道則會直接通往綠青市的舊怪伐軍醫院。
緊接著鶇觀察到那岐就在那輛開往舊怪伐軍醫院的巴士中，眾人決定追蹤巴士前往舊怪伐軍醫院一探究竟，並嘗試營救那岐。
來到舊怪伐軍醫院後魯卡告訴眾人，根據他對高級情報中各種蛛絲馬跡的分析，舊怪伐軍醫院很有可能還在繼續投入使用之中。為了徹底搞清楚這一切，結人等人繼續深入醫院。
從房間兩側的通道繞開中央的房間來到樓梯處，通過樓梯到達二層。
來到二層後左轉沿著走廊繼續前進。
來到柵欄門前，我們可以通過使用魯卡的瞬移能力，啟動SAS後墊步會變成瞬移從而穿過柵欄進入後方的房間。在房間中會有三隻卑賤醉鬼埋伏，准備進入戰鬥。
在此處我們還會遭遇一種名為盤基爪牙的怪物，該怪物的弱點位於腿部。但當我們直接靠近該怪物時怪怪物會蹲下將腿藏入外殼中，此時該怪物為無敵狀態。
但當我們遠離後該怪物就會站起將腿部露出，激活SAS使用魯卡的技能通過瞬移接近該怪異即可將其消滅。
消滅敵人後沿著走廊繼續前進，通過房間中的門到達記錄人處。
離開記錄人所在房間後右轉，在前方房間與大量卑賤醉鬼戰鬥，將其全部消滅即可。
隨後我們會遭遇一種名為弩炮師聖誕的怪異，該怪異會揮舞頭部的觸手攻擊周圍的單位。當我們距離他較遠時，該怪異則會發射炮彈進行遠程攻擊。
想要消滅該怪異需要先破壞其外殼，火屬性攻擊能夠更加有效的破壞外殼。
隨後向前來到天井處，沿著天井旁的通道前進到達醫院的另一側。
隨後繼續向前消滅怪異後，眾人終於找到了失蹤多日的那岐，但那岐卻表示自己已經受到所謂人格矯正，不知道什麼時候會被切換人格而攻擊結人。同時他還勸結人抓緊離開此處，否則同樣會受到人格矯正。
突然之間醫院的警報被觸發，魯卡在通過瞬移將所有人帶至安全的地方後，眾人決定先離開醫院再討論下一步的行動。
離開房間後右轉逃離醫院。
在道路最前方進入左側房間准備與怪異戰鬥。
消滅房間中的弩炮師聖誕和盤基爪牙。
在前方房間中我們會遭遇一隻油滑脊怪，該怪物的攻擊方式與之前遭遇的酒釀脊怪相似，只是該怪物可以隱身，通過鶇的能力即可找出該怪物。
在最後一個房間中正在為找不到路而發愁時，突然出現一隻強大的怪異泥濁飼魚者。泥濁飼魚者同樣會從遠處飛撲至我們所在位置，落地後同樣無法行動。
泥濁飼魚者會從遠處發射一條跟蹤我們當前位置的油線，使用墊步或跳躍都可以進行躲避。
泥濁飼魚者揮舞手臂向前方發起攻擊。
泥濁飼魚者會跳至天花板上，並向下噴灑出背部油罐中的魚，魚會對我們發起攻擊，保持移動及時躲避。
當泥濁飼魚者爬至天花板上時，我們可以使用念力破壞天花板，將泥濁飼魚者摔至地面，隨後泥濁飼魚者將無法行動我們可以隨意進攻。
在將泥濁飼魚者消滅後，吹雪也已趕到醫院，將眾人從醫院中帶出。吹雪將直見怪異化的真相告知給了眾人，原來這一切都是新日向政府的研究成果。在讓眾人放心離開，收尾工作交由他負責後，吹雪先行離開了此處。
隨後打開世界地圖，來到已經非常熟悉的黃朽葉中層商店街。
在消滅途中全部怪異來到指定地點後，魯卡告訴眾人吹雪之所以會調查這些事情全部是因為吹雪的未婚妻也是花火的姑姑-艾麗斯一條也在多年以前變為了怪異。
就在眾人交談時鏡花小隊再次出現，重也准備再次殺死結人。
隨後我們要與重、嵐和陽炎戰鬥，建議優先擊敗嵐和陽炎，最後再擊中火力擊敗重。
正當雙方僵持不下之際木靈小隊的隊長木靈梅侖趕來支援，逼退了鏡花小隊。
同時木靈帶來了怪伐軍醫院給結人開具的藥物，但結人打開之後卻發現與之前直見怪異化後所留下來的安瓿一模一樣。
隨後眾人返回基地進行休整和情報的匯總。
返回基地後陽炎突然發來信息表示有關於鶇的很重要的事情要與結人談談，雖然現在雙方立場有所衝突但結人還是選擇了前往結緣家與陽炎會面。
在於陽炎見面後結人發現，原來他只是單純的放心不下性格內向的鶇，擔心鶇在小隊中無法與夥伴融洽相處特此來拜託結人照料鶇。
在稍作由於後結人向陽炎詢問他父親死亡當天發生的事情，以及真正的兇手是否就是重，但陽炎卻表示此時還無法告訴結人真相。在一番閒談後約定下次見面，結人與陽炎告別返回基地。
在基地中我們會受到重的來信，表示從今往後會重將不會再與結人聯系，而結人再次嘗試向重詢問事情的真相卻仍然遭到了重無情的拒絕。
而重也說到做到將結人的聯系方式全部封鎖，因此結人將繼續獨自追尋事情的真相。
與蓋曼交談即可開啟羈絆章節任務。
為了讓蓋曼重新追趕上當前年輕人的潮流，結人邀請蓋曼一同逛街參與年輕人的娛樂。但蓋曼卻完全無法理解這些活動，在與蓋曼一同享用過晚餐後二人重新返回基地當中。
與魯卡交談開啟羈絆章節任務。
結人為了進一步瞭解夥伴，因此向魯卡打聽他自己的情況，在被問到興趣時卻出乎意料的得知魯卡最喜歡興趣是健身。在魯卡和結人約定好之後一起健身後，該羈絆章節完成。
當眾人在基地休息時吹雪突然出現，並告訴告訴眾人卡連已經離開了怪伐軍前往青藍，吹雪接替了卡連之前的職責為新日向政府辦事。但與結人等人同樣的是，吹雪也表示自己想要查明國家腦部實驗的真相。
雖然繼續深入調查等同於背叛新日向政府，但小隊中大部分成員都表示要和結人一同調查真相。而魯卡也告訴眾人了一個巨大的秘密，他與他的哥哥卡連其實也都曾經參與過實驗，接受了超腦力強化的改造。
同時為了讓不願參與此時的隊員抽身事外，雪吹為結人小隊安排了一個常規任務，以通過常規任務完成程序，從而使其他隊員能夠離開結人小隊。
接下來我們需要通過世界地圖前往水波川的施工區域。
在來到施工區域後鶇表示也要留在結人的小隊，但還沒來得及多說什麼眾人就遭到了怪異的細節，隨後開始戰鬥將出現的怪異全部消滅。
將所有怪異消滅後結人抱著頭蹲下隨後失去記憶，在擊敗消滅後與魯卡和蓋曼所說的話已經完全沒有任何印象了。
而伴隨著失憶，結人的語言功能也開始退化，無法說出完整的話語。
就在結人尚未恢復之時怪異卻突然發起了襲擊，由於腦部障礙結人暫時無法整場戰鬥。
在危急關頭結人義無反顧的喝下之前木靈隊長送來的安瓿中的藥物。
將藥物喝下後效果立竿見影，各種異常狀態全部消失，超腦力和語言能力也恢復正常，隨後與怪異戰鬥並將其消滅。
離開當前所在位置，消滅外部的全部敵人後向下一處施工工地前進。
沿著建築工地的外側道路繼續前進。
在前方鶇探查到有兩輛貨車在向青藍一帶移動，隨後在後方提供信息支援的渡也再次確認了該消息，並通過錄像發現這是怪伐軍的運輸車輛。
但當眾人准備追蹤運輸車時，鏡花和伊登突然出現並對結人小隊發起了進攻，此處無需擊敗陽炎和鏡花，只需拖延一定時間即可完成戰鬥再次進入劇情。
鏡花和陽炎的出現明顯是為了阻攔結人等人追蹤運輸車，而在運輸車成功脫離後鏡花和陽炎也在復制能力製作的障眼法中撤退。但盡管如此，渡還是根據已有的情報分析出了運輸車最有可能的目的地——特異生命研究設施。
當眾人來到特異生命研究設施時，果然在此處發現了之前鶇探查到的運輸車輛。
在魯卡通過瞬移能力對運輸車進行調查後，眾人發現原來運輸車中運送的竟然是一個又一個的人頭。為了搞清楚事情的真相，結人小隊眾人決定繼續深入設施調查。
眾人在准備深入基地時被需要身份權限才能夠解鎖的大門阻攔，在多次嘗試無果時一名設施的研究員發現了眾人，再將研究院制服後從其身上獲得了1級權限身份卡，隨後打開大門正式進入研究設施。
進入設施後左轉來到下圖所示位置，消滅房間中的怪異繼續前進。
離開房間後右轉繼續與怪異戰鬥並將其消滅。
通過樓梯向上到達設施2層。
在二層左側區域盡頭處，使用魯卡的瞬移穿過貨架。
在後方的房間中我們可以找到2級權限身份卡。
隨後來到2層正中間的大門處使用身份卡打開大門繼續深入。
在下一個房間中我們可以看到記錄人，記錄人旁邊的大門需要3級權限卡才能打開，因此我們需要先來到房間盡頭後左轉。
再次來到1層後我們直接進入房記錄人對面的房間。
來到房間右側區域消滅出現的怪異。
隨後通過房間右方的通道進入下一個房間中，右轉消滅大量的怪異。
在盡頭處的房間中穿過貨架獲得3級身份權限卡。
回到2層的記錄人處，使用3級身份權限卡開門。
消滅房間中出現的全部怪異後獲得4級身份權限卡。
來到1層的記錄人處，使用4級身份權限卡開門並進入0級實驗區域。
在0級實驗區域眾人發現了大量與剛剛在運輸中發現的相同的箱子，而魯卡則告訴大家在這座建築其實是飼養怪異的設施，運輸人類的大腦則是為了餵養怪異。而眾人在旁邊的桌子上，則發現了印有詩賓制藥字樣的，與直見和結人手中樣式相同的安瓿。
而就在此時嵐、重和紫電突然出現並襲擊了結人小隊，隨後與三人開始戰鬥。
將3人擊敗後嵐告訴眾人，該設施的目的是為了研製針對怪異的藥物，目前階段給由人變成的怪物注射會使其恢復理智。該設施是由卡連連隊長認同，並獲得了一眾類似重有親人朋友變為怪異的怪伐軍的支持。
在眾人進行交談時結人突發頭痛，而我們也可以看出重仍然十分在意結人的狀況。卻沒想到嵐突然按下了警報，而結人等人需要抓緊時間撤退否則將面臨眾多的給怪異圍攻。
眾人再回到基地後，紛紛出言安慰因為使用過藥劑所以仍然處於嚴重心理不適狀態的結人。並在總結交流信息後，准備暫時休整。
回復鏡花的信息後開始與鏡花的羈絆章節。
在結緣家中因為最近的事情，鏡花在試圖安慰結人，但不小心暴露出自己從結人小時候就認識他的信息。在一番交談後二人反別，各自返回自己的小隊。
回復嵐的信息開始與嵐的羈絆章節。
嵐以開發了全新的SAS系統為由約結人在結緣家見面，一番調試後卻給結人安裝了一個暫時無法使用超腦力的系統，原來嵐是想借來之不易的空閒時間讓結人充分休息，避免腦力使用過度帶來的各種症狀。
嵐也在一直試圖嘗試讓結人放鬆和學會偷懶，並親自做出了示範。在休息時間結束後，嵐將限制腦力的程序卸載，二人就此分別。
與魯卡交談開啟新的羈絆章節。
結人請求跟隨魯卡一同訓練健身，在體驗過魯卡的苦修之後結人也對七劍星的實力有了一個更加直觀的認知。
在完成該羈絆章節後與魯卡的羈絆等級會到達2級，在2級後我們使用魯卡的能力時，可以在空中進行瞬間移動了。
與鶇交談開啟羈絆章節。
在經過鶇不懈的努力之後，終於找到了結人記憶中的白花。這種名為白雪靜草的花朵是一種生長在高處的，十分罕見的花朵
而鶇為了能夠讓結人見到真正的花朵，決定繼續尋找這朵花的相關信息，希望能夠將其培育出來。
羈絆劇情結束後，我們與鶇的羈絆等級會升到3級。之後我們在戰鬥中使用鶇的能力時，精準迴避後按下滑鼠右鍵能夠發動看穿念力攻擊，對敵人造成巨額傷害。
正當眾人休整時吹雪連隊長突然發來訊息，約眾人前往之前的安全區域會面。但由於之前剛剛發現詩賓制藥工廠的事件，眾人決定在後續的會面中，同樣要對吹雪連隊長保持一定程度的戒備。
在安全區域中吹雪連隊長告訴眾人他已經在不影響眾人行動的前提下，向新日向政府報告了詩賓制藥工廠的情況。吹雪還告訴眾人這座工廠一開始就是由他和卡連提議建立的，同時怪異化的艾麗斯就生活在那座工廠之中。其建立的目的就是為了醫治艾麗斯，但後續出現的安瓿和叛亂完全出乎吹雪等人的意料之外。
而對於青藍和蘇芳的人體實驗，吹雪連隊長則認為這些實驗要麼出於強化超腦力，要麼則是為了尋求控制怪異本身的方法。但是在實際上，所有人都不知道怪異的真實面目究竟是什麼。吹雪和卡連曾經計劃將人類怪異化時的影像傳送至所有國民腦中，但一直苦於沒有決定性的證據。而之前由於那岐經過人格矯正後，腦中的直見怪異化的數據會被取出並在舊怪伐軍醫院保管，因此眾人決定前往醫院尋找該數據。
隨後打開世界地圖再次前往舊怪伐軍醫院。
再次來到舊怪伐軍醫院後，大樓中的怪異普遍會獲得隱身的能力，注意多觀察四周防止被怪異偷襲。
我們在大廳正前方的樓梯前，可以找到神秘文書數據01，隨後通過樓梯到達大樓2層。
神秘文書數據01內容如下。
到達2層後使用魯卡的能力穿過柵欄。
消滅房間中出現的全部敵人。
隨後通過房間的小門繼續前進。
在前方房間處使用魯卡能力穿過柵欄獲得神秘文書數據02。
神秘文書數據02內容如下。
在記錄人旁邊房間的箱子後面可以找到神秘文書數據03。
神秘文書數據03內容如下。
繼續前進在下圖所示房間中與大量怪異戰鬥。
來到天井處後同樣沿著迴廊繼續前進。
在前方我們可以找到神秘文書數據04，注意在獲取數據前需要先消滅區域中全部的敵人。
神秘文書數據04內容如下。
使用瞬移穿越道路前方右側的小門。
在房間中我們可以獲得神秘文書數據05。
神秘文書數據05內容如下。
繼續前進來到下圖所示房間後消滅出現的全部怪異。
離開第二個記錄人所在房間後左轉，消滅前方攔路的怪異。
在旁邊一側房間的書架上可以找到神秘文書數據06。
神秘文書數據06記錄人內容如下。
隨後返回剛剛記錄人所在房間出，進入對面房間左轉，通過樓梯到達大樓三層。
來到三層後首先使用瞬移穿過第一道柵欄門。
在通道盡頭處的箱子後面可以找到觀測文書數據07。
神秘文書數據07上半部分內容如下。
神秘文書數據07下半部分內容如下。
返回剛剛來到3層的入口處再次使用瞬移穿過前方右側的柵欄。
在盡頭房間的桌子上可以獲得神秘文書數據08。
神秘文書數據08內容如下。
隨後返回穿過柵欄，進入道路左側的房間，沿著道路繼續前進消滅前方的怪異。
穿過怪異所在房間後來到天井，左轉向前進入道路左側的房間中。
在房間的桌子上可以找到神秘文書數據09。
神秘文書數據09內容如下。
繼續前進在下圖所示房間中於怪異戰鬥。
離開與怪異戰鬥的房間後，在前方道路右側可以找到神秘文書數據10。
神秘文書數據10上半部分內容如下。
神秘文書數據10下半部分內容如下。
在記錄人處存檔並恢復狀態後沿著道路繼續前進。
在最前方的房間中我們會再次遭遇那岐卡門，而被人格矯正後的那岐一心想要結人等人也接受人格矯正，無奈之下與那岐開始戰鬥。
那岐會使用風能力發射飛鏢。
近身戰鬥時那岐連招的最後一段攻擊時在其身體周圍製造旋風，注意及時遠離躲避該攻擊。
那岐卡門會製造煙霧遮擋視野，及時使用鶇的能力找到那岐卡門。
那岐會在自身上方匯聚風刃並分多次發射風刃，使用念力攻擊即可打斷其蓄力。
在擊敗那岐後結人的腦部突發狀況失去意識，但在昏迷中結人卻隱約夢到了小時母親的臉龐。
再次清醒過來的結人發現自己被人關在一個，與自己小時候住院時所生活的房間十分相似的屋子中。
在結人迷茫之際醫院的研究員出現，此人正是負責小時候結人住院當中一系列事宜的人。此研究員告訴結人，在結人小時候其實是一名無腦力者，後續通過手術改造才成功擁有了腦力。而與他情況相似的案例還有卡連和魯卡兄弟二人，但只有結人發生了腦力退化的情況。
隨後吹雪來到研究所將結人和其他人救出，在將一件重要物品交給結人保管後讓他們先行逃離研究設施。
消滅設施中的怪異後沿著道路一路前進。
離開研究設施返回醫院一樓大廳後消滅出現在此處的蘇芳國防軍。
消滅全部敵人後卡連連隊長突然出現，並告訴結人他已經被新日向政府列為背叛者，且被禁止進入蘇芳，而代表青藍反叛軍的卡連則試圖邀請結人的加入。
但無論是青藍還是蘇芳，對於他們的人體實驗結人都無法接受，准備接下來前往渡月尋找機會。而一直配合我們的渡也來到了基地中，繼續和結人等人一同作戰。
與蓋曼交談後可以開啟羈絆章節。
蓋曼告知結人他有一位多年的從怪伐軍退役的好友，突然失去了全部聯絡。在聽完蓋曼訴說苦惱並認真安慰他後該劇情結束。
完成任務後我們與蓋曼的羈絆等級到達3級，在3級羈絆下我們激活蓋曼的能力後，能夠讓所有異常狀態失效。
與花火交談即可開始新的羈絆章節。
花火由於之前在戰鬥使用能力使將周圍的建築燒焦，為此在一直自責中。同樣的在安撫花火之後，我們與花火的羈絆等級會到達3級。
3級羈絆後，花火的SAS點火量表恢復速度會提高。在眾人休息完畢後，通過調查功能開啟下一步任務。
在蘇芳和青藍都無法容忍的情況下，結人小隊一致同意前往渡月以尋求更多的情報。而花火的伯父所代表的怪伐軍醫院也曾和渡月有過貿易往來，此時就顯得渡月格外可以，因此眾人又多了一個不得不去渡月的理由。
來到渡月周邊後沿著道路前進，在前方我們會首次遭遇到鳴奏轟爆，該怪異會在接近我們後自爆對我們造成大量傷害。我們可以使用蓋曼和魯卡的能力，格擋或閃避掉爆炸攻擊。
沿著道路前進消滅沿途的怪物，在冰牆處我們可以是用花火的能力破話冰牆。
來到渡月後從大門直接進入即可。
在來到渡月後結人等人收到了渡月教信徒的隆重歡迎，在深入渡月後信徒告訴眾人需要坐在桌子前向鏡像詢問並獲得答案。
在花火坐下准備開始提問時，視覺形象出現了鏡花的形象，在驚呼下喊出鏡花的名字後眾人得知鏡花是在渡月被製造出來的設計孩童。而設計孩童就是組合特定的基因，隨後設計成擁有任意外貌或能力的人類，而鏡花伊登是根據兩千年前渡月教的創始人一夜波普博士所創造出來的。
在向視覺影響詢問新日向成立的情況時，視覺影像留下一句「月球會默默守護著你們」就突然消失了。經過眾人分析可能是該機器不具備如此高的權限，准備前去下一台機器再做嘗試。
在第二個機器處由蓋曼進行提問，得知新日向是由2020年前地球上一個名為方舟隊的組織成員所建立的國家，而方舟隊則是從月球降落至地球的移民團。人類則是在大約3000年前，為了延續種族選擇了從地球全體移民至月球。當眾人問及月球上人類現狀時，影響則再次消失了。
在第三台儀器處，眾人得知由於斷絕之帶的影響，地球已經無法和月球取得聯系，因此也無法得知月球的現狀如何。而在當年移民團來到地球時，還沒有斷絕之帶的存在。在詢問怪異與斷絕之帶的關系時，影像再次消失。
第四台儀器由魯卡負責提問，在詢問怪異的真相後得知需要登錄所謂的「貝比」才能夠獲得相應答案。雖然沒有回答有關怪異的問題，但影像告訴眾人高速路上方的偽黑洞岐之門，其中的重力將不斷增長，在不久的將來吞噬地球。而岐之門之所以會擴大則是由於收到了結人皇的超腦力影響。
當眾人追問結人皇與岐之門的關系時，影響留下一句「讓錯誤的宇宙從頭來過，實現正確的未來」後就再一次的消失了。
與突然出現的渡月教信徒交談，得知我們正對著的便是通往貝比的大門，而貝比其實就是管理渡月的主腦類似蘇芳的荒吐神。
在渡月教信徒的引導下結人坐在了貝比之前，就在結人開始連接時卻發現渾身動彈不得，。隨後結人的視線中出現了一名與重十分相似的女子警告結人遠離貝比中斷連接，而不知為何重也出現並警告結人。此時結人才反應過來貝比正在試圖侵占自己的大腦，隨後向夥伴求救。
在魯卡將結人從儀器前帶離後，重告知結人她此時也在渡月附近。但嵐等人卻被渡月教信徒抓住，因此重拜託結人營救他們。
魯卡操縱貝比將渡月所有的門打開後眾人准備離開渡月，但在渡月入口處眾人卻遭到了渡月教信徒的攻擊，在將其擊敗後卻發現信徒的面容與鏡花和重十分相似。
離開渡月後沿著道路消滅怪異不斷前進，在前方與突然出現的強大怪異席捲亂象作戰。
該怪異會向前方發射大片冰塊攻擊。
該怪異會舉起前肢砸向地面，隨後會從我們所在位置地下伸出冰柱進行攻擊，注意保持移動即可。
該怪異渾身覆蓋著冰塊，我們可以通過使用花火的能力破壞冰塊使怪異露出本體。在冰塊被破壞後，噴射冰塊的招式會變為噴射水柱。
席捲亂象會圍繞自身召喚水柱，注意快速遠離即可。
在覆蓋身體的冰塊消失一定時間後，該怪異會鑽入地下重新為自己裹上冰塊。
該怪異的弱點為其背部類似燈泡一樣組織，終點攻擊該部位即可快速將其消滅。
在將席捲亂象消滅後，重發來消息想與結人交換在渡月中獲得的情報。
在於重小隊會面後，結人向重詢問為何要追殺自己，而重的回答卻出乎所有人的意料，她表示這是50年後的結人自己拜託給重的事情。
重告訴眾人在高速公路賽特先生去世之後，她顯現了時間跳躍的腦力紅色系線，並且和嵐一同來到了50年之後。
隨後詢問重小隊當時的具體情況，得知結人的能力其實是重力操控，只不過表現形式與念力十分相似，當重力操作強到足以穿越時空就會被稱為紅色系線。而高速路上的岐之門是重的能力製造的，但通過結人的腦力共鳴後導致岐之門無法關閉。
而在未來世界中岐之門確實同結人在渡月獲得的情報重那般，成長到了足以毀滅世界的程度。而未來的結人確認只有在岐之門尚未完全成型前，將自己殺死才能夠拯救未來世界，因此才拜託重來消滅年輕時的自己。
當眾人分享至月球的相關信息時，陽炎表示自己正是移民團的一員，在渡月經過漫長的人公冬眠後才再次蘇醒。陽炎告訴眾人一心想要留在地球的人建立了新日向，而想要回到的月球的人則成立了渡月。而為了逃離地球和拯救被怪異攻擊的月球，渡月的人則准備進行時間跳躍，讓一切回到事情沒有發生以前。
直到此時眾人突然意識到，相比新日向和青藍對於怪異的研究，渡月的陰謀對於所有人來說其實更加可怕。
重和結人決定繼續分頭行動，同青藍和新日向交涉以共同阻止渡月的陰謀。
和鶇交談開啟羈絆任務。
鶇告知結人之前在前往渡月時經過的寒冽山上可能會有白雪靜草的相關線索。
與鶇一同來到寒冽山，消滅出現的全部怪異。
在將所有怪異消滅後，山上的白雪靜草卻也遭到了破壞。隨後二人決定將花留在此處任由其自行生長，而不是將其帶回基地。隨後二人返回基地，該任務完成。
在完成該任務後我們與鶇的羈絆等級會到達4級，4級羈絆時鶇的腦力SAS量表回復速度會加快，同時在特定時機按下V鍵可以召喚鶇幫助我們攻擊敵人。
與魯卡交談開啟羈絆任務。
魯卡向結人詢問是否有在舊怪伐軍醫院中獲得他們兄弟二人的相關情報，在一番交談後該任務完成。
完成該任務後與魯卡的羈絆等級會到達3級，魯卡的腦力SAS量表恢復速度會加快，同時按下Ctrl+F1-4可以發動特殊的組合技能。
在訊息中回復嵐的消息即可開始羈絆任務。
二人再次就偷懶這個話題談論一番後返回基地完成該任務。
回復紫電的訊息後即可開始羈絆任務。
紫電表示想要對戰鬥方式給結人一些建議，但由於其獨特的表達方式，最後二人不歡而散。
回復陽炎的訊息後開始羈絆任務。
陽炎帶領著結人四處遊玩，在臨近傍晚才結束，二人返回基地羈絆任務完成。
眾人決定前往蘇芳會見結人皇的兄長嘗試談判。
來到蘇芳後眾人遭受被洗腦的那岐攻擊，將那岐擊敗後雖然解除了他的洗腦，但那岐依然由於傷勢過重失去了生命。
來到怪伐軍駐地後從界人處得知新日向政府准備通過SAS系統連結全部國民，從而達到向月球復仇的目的。
離開怪伐軍駐地後來到安全區域進一步商討作戰計劃，眾人決定前往荒吐神並通過其將新日向政府的計劃公之於眾。
來到荒吐神後通過念力放下橋梁繼續前進。
消滅前方區域中的全部敵人。
操控機關打開大門繼續前進。
使用瞬移穿過雷射網。
來到升降梯處，通過升降梯前往神社庭院。
放下橋梁後通過後方的控制台打開貳號門。
通過貳號門後繼續前進，通過左側道路來到下圖所示位置，操縱機關打開叄號門。
沿著道路繼續前進，注意躲避側面平台上的怪物的攻擊。
將全部怪物擊敗後通過升降梯到達拜殿。
操控控制台打開肆號門並繼續前進。
使用瞬移穿過左側的鐵絲網並消滅隨後出現的怪異。
操控控制台解鎖伍號門。
繼續深入通過前方的控制台解鎖陸號門。
到達荒吐神後結人使用主腦准備將真相公之於眾，正在此時卡連突然出現阻止了眾人。
卡連的目標是奪取結人的超腦力，為了自保與卡連戰鬥並將其擊敗。
結人小隊被卡連從荒吐神中召喚出的導線控制無法繼續戰鬥，卡連也通過導線嘗試侵占結人的意識。
在回憶空間中不斷前進。
在危急關頭重小隊出現出現並將結人喚醒，隨後大家一同返回基地修正。
與紫電交談即可提升羈絆等級。
當與紫電的羈絆到達2級時，按下C鍵即可釋放電流造成大范圍傷害。
與鏡花交談後羈絆等級即可到達2級。
在承受攻擊時鏡花的影像有可能會出現並為結人格擋傷害。
與陽炎交談即可提升羈絆等級。
與陽炎的羈絆等級到達2級後，在受到攻擊時陽炎的影像可能會出現並為我們抵擋傷害。
與嵐交談以提升羈絆等級。
與嵐的羈絆等級到達2級後，在受到攻擊時嵐的影像可能會出現並為我們抵擋傷害。
與重交談即可提升羈絆等級。
當與重的羈絆等級到達2級後，重的影像就會有幾率出現幫我們格擋傷害。
再次與重交談開啟羈絆任務。
在向重表達謝意後羈絆等級到達3級，在戰鬥中按下Ctrl+F1~5可以發動特殊攻擊了。
與花火交談即可開啟羈絆章節。
與花火來到舊怪伐軍醫院地下的實驗設置中，消滅怪異救出被襲擊的女子。
從女子處獲得裝有設施全部數據的硬碟，隨後與花火返回基地完成任務。
完成羈絆任務後與花火的羈絆等級到達4級，在戰鬥中按下V鍵即可召喚花火協助戰鬥。
與蓋曼交談開啟羈絆任務。
蓋曼拜託我們幫忙調查他的朋友在住進醫院後離奇死亡的真相。
根據渡提供的情報，二人追蹤從醫院離開的火車來到水波川，消滅出現的全部怪異。隨後二人發現原來許多無法繼續戰鬥的士兵被醫院當作垃圾一樣丟棄，隨後返回基地即可完成任務。
眾人為了摧毀渡月的計劃准備前去破壞中央計算機貝比。
在作戰開始之前陽炎約我們前往黃朽葉交談。
消滅沿途的怪異後來到建築工地的最高層與陽炎交談，陽炎也告訴結人他父親死亡的真相。
與陽炎戰鬥並將其擊敗。
陽炎隨後也承認自己是渡月派出的暗殺者，為了徹底結束這一切眾人需要盡快摧毀渡月。
來到寒冽山後消滅出現的全部怪異。
隨後通過陽炎的能力將眾人全部隱身以此潛入渡月。
在進入渡月後眾人遭到了設計孩童的圍攻，情急之下魯卡使用超能力將眾人帶至了貝比所在區域，沿著道路消滅怪異並前進。
使用紫電的能力為機關通電後打開前進的大門。
當眾人來到貝比處時，貝比想要利用結人母親的影像來拉攏結人和重。
在眾人拒絕後貝比釋放出巨大的怪異公寓群怪，我們需要快速向右跑擺脫公寓群怪的追擊。
通過變動上下為止躲避怪異的襲擊。
躲避公寓群怪發射的紅色光線沖擊。
逃脫公寓怪群的追擊後眾人將貝比破壞。
為了進一步調查紅色系線能力，重和結人准備聯合其他人的超腦力穿過岐之門回到過去。
回到過去後重與結人的母親若菜相遇，而若菜早已從未來得知了重的存在。
若菜將一個特製的可以避免結人記憶障礙的耳骨夾，而這個也是遊戲剛開始時，結人記憶中的重交給他的飾品。
隨後結人和重一同將若菜從過去帶回現在，眾人決定先行返回基地休整以商討下一步的計劃。
與魯卡交談即可開啟羈絆任務。
隨後與魯卡一同來到怪異研究設施，深入設施並消滅沿途出現的全部怪異，隨後與魯卡一同返回基地。
完成任務後與魯卡的羈絆會到達4級，在戰鬥按下V鍵即可呼喚魯卡協助戰鬥。
與陽炎交談即可開啟羈絆任務。
與陽炎交談後即可完成該任務。
完成任務後與陽炎的羈絆等級會到達3級，按下Ctrl+F1~5即可發動特殊攻擊。
和鏡花交談開啟羈絆任務，與鏡花一同前往結緣家。
一番交談後與鏡花的羈絆等級到達3級，在之後的戰鬥中可以使用鏡花的特殊組合攻擊了。
與鶇交談開啟羈絆任務。
與鶇交談後完成任務。
與嵐交談即可開啟羈絆任務。
與嵐和吹雪交談後完成任務，完成任務後與嵐的羈絆等級到達4級，在戰鬥中按下V鍵即可召喚嵐的影像協同攻擊。
與重交談開啟羈絆任務。
與重交談後完成任務，完成任務後與重的羈絆等級到達4級，在戰鬥中按下V鍵即可召喚重的影像協同攻擊。
與紫電交談開啟羈絆任務。
與紫電交談後羈絆等級到達3級，在後續的戰鬥中可以釋放紫電的特殊組合攻擊了。
眾人與若菜一同來到岐之門處，若菜告訴大家岐之門之所以會出現是因為結人和重的超腦力糾纏，只需要解開糾纏即可關閉岐之門。
沿著道路前往纏結所在位置。
消滅全部怪異後解開纏結
在解開最後一個纏結時，結人和重再次看到了八雲皇當年被害的畫面，而這次畫面中出現了卡連的身影。
揭開全部纏結後結人和重回到現實世界，但卻發現岐之門並未消失。
若菜告知結人和重她的存在也是時空纏結之一，為了徹底關閉岐之門同時不讓渡月獲得自己的記憶，若菜來到了研究設施，通過人格矯正裝置為自己的腦部帶來過量負擔結束了自己的生命。
在若菜死後最後一個影像岐之門關閉的纏結就是穿越時空殺害了八雲皇的卡連，眾人接下來的目標就是將卡連帶入岐之門並讓他解開纏結。
與陽炎交談開啟羈絆任務。
從界人手中救下前去自首的陽炎。
完成任務後與陽炎的羈絆等級到達4級，在之後的戰鬥中按V鍵即可召喚陽炎幫助戰鬥。
與鏡花交談即可開啟羈絆任務。
幫助鏡花完成她不擅長的料理即可完成任務。
完成任務後與鏡花的羈絆等級到達4級，在之後的戰鬥中按V鍵即可召喚鏡花幫助戰鬥。
與重交談即可開啟羈絆任務。
與重一起前往黃朽葉的大樓屋頂，消滅途中遭遇的全部怪異後完成任務返回基地。
與魯卡交談開啟羈絆任務。
與魯卡一同攀登寒冽山，隨後返回基地即可。
與紫電交談開啟羈絆任務。
一番交談後二人返回基地即可完成任務。
完成任務後與紫電的羈絆等級到達4級，在戰鬥中按下V鍵即可召喚紫電進行戰鬥。
與蓋曼交談開啟羈絆任務。
與蓋曼一同前往神社為蓋曼的戰友掃墓後返回基地。
完成任務後與蓋曼的羈絆等級到達4級，在戰鬥中按下V鍵即可召喚蓋曼進行戰鬥。
與花火交談開啟羈絆任務。
與花火交談後即可完成任務返回基地。
眾人來到皇陵，在界人的配合下進入皇陵以徹底關閉岐之門。
來到皇陵底部後沿著通道深入皇陵。
深入皇陵後眾人意外陷入了一個神秘空間中，沿著道路前進並消滅全部怪異。
而在這個神秘空間中眾人也能隨著不斷地深入見到艾麗絲與卡連的記憶。
在空間最深處我們會遭遇一隻名為吾主馬戲團的強大怪異，第一階段該怪異會從手中的傘里發射水柱進行攻擊，保持移動躲避即可。
我們需要等待其召喚水龍卷後，使用閃現穿過水牆攻擊怪異拿傘的手臂。
第二個階段中該怪異會從鼻子里噴出紅色的煙霧，注意躲避。
在一段時間後該怪異會釋放煙霧阻礙視線，此時使用鶇的能力即可找到怪異的位置，攻擊其頭部的弱點即可。
第三個階段怪異會使用手中的鑽頭發動沖鋒攻擊，躲避其攻擊將其擊敗即可。
隨後吾主馬戲團會變身為前三種形態的集合並依次使用其特殊招式暴露弱點，繼續戰鬥直到將其擊敗即可。
繼續沿著道路深入空間，眾人也得知了卡連的真正目的。卡連正在一次又一次的時間跳躍，尋找拯救艾麗絲的方法。
來到空間的最深處，眾人見到了現實的卡連和偽裝成八雲皇的卡連，而他們的時間跳躍也因為眾人的干擾出現了問題。
隨後與卡連進行戰鬥。
將第一階段的卡連擊敗後，卡連的瘋狂和執念召喚出了巨大的怪異。
首先我們需要通過攻擊來消滅七星扇。
通過投擲七星扇來破壞悲嘆。
將悲嘆破壞後它的面具會出現在場地中央，對其面具使用超腦力使卡連本體暴露出來。
隨後快速攻擊卡連本體即可。
隨後快速攻擊並破壞塊狀結晶。
利用塊狀結晶的碎片擊落怨恨的面具，隨後利用面具破壞保護卡連的屏障快速攻擊卡連。
之後進入第三輪戰鬥，破壞場地中的錘狀結晶。
利用錘狀結晶後的錐體擊落憤怒的面具，隨後重復之前的流程攻擊卡連即可。
第四次破壞柱狀結晶，並徹底擊敗卡連召喚出的怪異。
隨後進入一片漆黑的空間中與卡連戰鬥。
在戰鬥的過程中夥伴不斷出現並提供幫助，最後在大家的共同努力下徹底擊敗卡連。
而在徹底說服卡連後，眾人來到岐之門處，通過卡連犧牲自己的最後的時間跳躍關閉了岐之門並消滅了斷絕之帶，一直困擾人類的怪異從此徹底消失，至此結人皇線的劇情就已全部結束。
來源：遊民星空
